Фамилия Гурькин образована по типичной русской модели с суффиксом -ин, указывающим на принадлежность: «чей?» — Гурькин, то есть сын или потомок человека по имени Гурька. Основа здесь — не полное каноническое имя, а его обиходная, разговорная форма. Гурька — это производное от крестильного имени Гурий (древнееврейское «львёнок»). В русском быту имя Гурий сокращали и «обкатывали» до звучания Гурька, Гуря, Гурка, отсюда и пошли фамилии Гурьев, Гуркин, Гурьянов и, собственно, Гурькин. Мягкий знак в середине фамилии сохранил память о мягком произношении исходной формы — именно Гурька, а не твёрдое «Гурка».

Встречается фамилия в основном в центральных и северных областях России, где имя Гурий было более распространено среди крестьян и духовенства. Особый интерес представляет вариант написания: через «ь» — Гурькин. Это не просто орфографическая случайность. В дореволюционных документах часто писали «Гурькинъ», и мягкий знак фиксировал реальное произношение, которое в некоторых говорах сохранялось как «Гурька» (с мягким «р»). В XX веке при унификации написания часть носителей могла перейти на форму Гуркин, но фамилия Гурькин осталась как архаичный, более точный слепок живой речи.

С точки зрения социального контекста, предки носителей фамилии Гурькин, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Фамилии на -ин в этой среде закреплялись за теми, чей отец или дед фигурировал в документах под уменьшительным именем — в переписных книгах XVII–XVIII веков запись «Ивашка Гурька» означала, что человека зовут Гурий, а в быту он Гурька. Его дети и стали Гурькиными. Среди дворянства эта фамилия не встречается — слишком «домашняя», непарадная основа.

Иногда фамилию ошибочно связывают с диалектным словом «гурька» (кувшин, крынка) или с тюркским «гур» (могила), но обе версии маловероятны: суффикс -ин в русских фамилиях почти всегда указывает на личное имя, а не на предмет. Правдоподобнее всего — происхождение от канонического Гурий через народную форму Гурька.