Фамилия Гусинин — один из множества русских родовых именований, «вылупившихся» из прозвища Гусь. В основе лежит не церковное имя, а мирское, и это типично для крестьянской среды: «птичьи» прозвища давали детям, чтобы обмануть нечистую силу или перенести на младенца черты животного — например, бдительность или важную походку.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Гусинин буквально означает «сын Гуся» или «человек из рода Гуся». Такая модель (основа на -а/-я + -ин) характерна для фамилий, образованных от прозвищ и имен, оканчивающихся на согласный. Интересно, что в русских говорах слово «гусь» имело и переносные значения: так могли назвать не только птицевода или пастуха, но и человека с горделивой осанкой, задиру или того, кто ходит вразвалку.

Менее убедительна версия, связывающая фамилию с украинским «гусінь» (гусеница). Фонетически и семантически это натяжка: прозвище от насекомого в русской антропонимии встречается редко, а суффикс -ин в таком случае требовал бы другого ударения и словообразовательной цепочки. Куда правдоподобнее, что предок носителя фамилии либо торговал гусями, либо пас их, либо сам отличался «гусиными» повадками.

Географически фамилия встречается в центральных и северных регионах России, где гусеводство было традиционным подспорьем в хозяйстве. В дореволюционных переписях Гусинины фиксировались в основном среди государственных крестьян и мещан — то есть сословий, где мирские прозвища сохранялись дольше, чем у дворянства.