Фамилия Гусинин образована от нецерковного имени Гусь. В русских деревнях «птичьи» имена давали младенцам по языческому обычаю: родители верили, что природа станет воспринимать ребёнка как своего, а к нему перейдут качества избранного животного — в данном случае, возможно, бдительность, домовитость или способность постоять за себя. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Гусинин буквально означает «сын Гуся» (как Птицын — «сын Птицы», Соколов — «сын Сокола»).

Есть и бытовая версия, хотя она менее правдоподобна: прозвище Гусь могли дать взрослому человеку по роду занятий — пастуху или торговцу гусями. В народе Гусем называли и гордеца, задаваку, что тоже могло стать источником прозвища. Совсем слабая гипотеза связывает фамилию с украинским словом «гусінь» (гусеница) — но для русской ономастики такая основа нетипична, и поддерживать эту версию нет оснований.

О точном времени и месте возникновения фамилии Гусинин говорить сложно: процесс закрепления фамилий в крестьянской среде шёл несколько столетий и завершился в основном к XIX веку. Однако сама модель образования — от мирского имени через притяжательный суффикс — одна из древнейших в русской фамильной системе. Фамилия Гусинин — не случайный набор звуков, а прямой след языческого имени, сохранившийся в современной русской культуре.