Фамилия Идиотина — редкий случай, когда современное звучание полностью искажает первоначальный смысл. В современном русском языке основа вызывает очевидные ассоциации с психиатрическим диагнозом, но этимология здесь совершенно иная. Фамилия образована не от слова «идиот», а от канонического мужского имени Иодий (или Иодик), которое восходит к греческому имени, связанному с фиалкой. В церковной традиции известен святой Иодий, но имя было редким и почти вышло из употребления. От него через просторечную форму Идиот (с утратой начального «о») и образовалась фамилия.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Идиотина — «дочь (или жена) Идиота». В русской ономастике фамилии на -ин обычно происходят от основ, оканчивающихся на -а, -я. Поскольку имя Иодий в быту могло звучать как Идя, отчество Идитин (сын Иди) закономерно перешло в фамилию Идиотин, а женская форма — Идиотина. По той же модели образованы фамилии от редких имен: Идиатуллин (от арабского имени) или Идигов (от тюркского Идиг).

В дореволюционных переписях фамилия встречалась в центральных губерниях России, особенно в Тверской и Ярославской, где были сильны старообрядческие общины, сохранявшие редкие календарные имена. Вероятнее всего, предок носителя фамилии был крестьянином или ремесленником, получившим прозвище по имени отца, которое со временем «потеряло» начальную букву в устной речи.

Написание с буквой «и» в корне закрепилось в XIX веке, когда медицинский термин уже вошел в обиход, но фамилия писалась по традиции. Встречается также вариант Идиотин (мужская форма), но «Идиотина» — более распространенная женская, которая закрепилась как основная в документах из-за того, что в семьях чаще фиксировали женщин.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Идиатов, Идиев — показывает, что все они восходят к одному корню, но с разными суффиксами. Фамилия Идиотина — одна из немногих, где неблагозвучное созвучие с диагнозом случайно, и ее носителям не стоит искать в ней медицинского подтекста.