Фамилия Игнатовская образована от мужского крестильного имени Игнатий. Латинское слово ignis, от которого оно происходит, означает «огонь», поэтому имя переводят как «огненный». Встречается и версия «неведомый» — от латинского ignoratus, но лингвисты считают её менее убедительной, так как народная этимология здесь смешивает корни.

В основе фамилии лежит просторечная форма имени — Игнат. Именно она, а не полный церковный вариант, была распространена в повседневном общении на Руси. Суффикс -овск-/-евск- в фамилиях на -ский указывает на принадлежность: Игнатовские — это потомки человека по имени Игнат. Такая модель типична для дворянских и шляхетских фамилий, но в XIX веке её активно перенимали крестьяне и мещане, особенно на западе Российской империи. Поэтому сословная принадлежность основателя рода неочевидна: он мог быть и выходцем из рабочей или крестьянской среды, и мелкопоместным землевладельцем.

Однако у фамилии есть и вторая, топонимическая версия. По всей России, Украине и Белоруссии разбросаны деревни и сёла с названием Игнатово. Если предок был уроженцем или владельцем одного из таких мест, то фамилия Игнатовская могла возникнуть как указание на его «игнатовское» происхождение — по названию имения или места жительства. В таком случае она не связана напрямую с именем Игнатий, а повторяет имя основателя самого поселения. Различить эти два пути происхождения по одной фамилии без генеалогических документов почти невозможно, но оба они ведут к одному корню — к имени Игнат.