Фамилия Ильлиных — редкий случай, когда написание расходится с произношением, и это сразу бросается в глаза. На слух фамилия звучит как «Ильиных», но на письме закрепился вариант с двумя «л». Такое несоответствие почти всегда говорит о том, что перед нами не опечатка, а историческая особенность — либо диалектное произношение, которое записали буквально, либо позднее канцелярское искажение.

Основа фамилии — имя Илья. По самой распространённой модели русских фамилий на -ин (-ын) её получили потомки человека по имени Илья. Форма «Ильлиных» — это родительный падеж множественного числа, характерный для северных и некоторых сибирских говоров: «ты из семьи Ильлиных?» отвечали «мы Ильлины». Такая модель (на -их, -ых) встречается реже, чем стандартная на -ов/-ев, и часто указывает на крестьянское или мещанское происхождение из регионов, где этот суффикс был нормой.

Удвоенная «л» в корне — главная загадка. В имени Илья исторически одна «л», и в подавляющем большинстве фамилий (Ильин, Ильиных) пишут одну. Двойная «л» могла возникнуть под влиянием церковнославянского написания имени «Иллиа» (с двумя «л»), которое иногда встречалось в святцах. Либо это местный говор, где мягкое «ль» перед «и» произносили с напряжением, и на письме это отразилось как «лл». Вероятнее всего, фамилия закрепилась именно в таком написании в документах XIX века, когда переписчики не всегда следили за орфографией.

Таким образом, предки носителей фамилии Ильлиных — скорее всего, крестьяне или посадские люди из северных губерний России, получившие фамилию по имени родоначальника Ильи. Уникальность фамилии в том, что она сохранила редкий графический вариант, который позволяет проследить, как местное произношение и канцелярская случайность создали нестандартную форму.