Фамилия Ильяков образована от названия реки Иляк - левого притока Кафирнигана — реки в Средней Азии, которая, в свою очередь, является одним из главных притоков Амударьи. Сам гидроним, возможно, происходит от слова «ил». Эта гипотеза подтверждается тем, что у реки Иляк илистое, топкое дно. Можно предположить, что основатель рода Ильяковых родился или долгое время жил на берегу этой реки. Согласно другой гипотезе, фамилия Ильяков ведет свое начало от производной формы мужского крестильного имени Илья (древнееврейское, «мой Бог – Бог истинный») - Ильяк. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Ильяк, со временем получил фамилию Ильяков.