Фамилия Ильянис звучит нехарактерно для русской среды, и сразу бросается в глаза её окончание. Это не типичный русский суффикс принадлежности, а скорее латинизированная или грецизированная форма. Такие фамилии обычно возникали в среде духовенства или у выходцев из южнославянских и балканских земель. В основе, как и положено, лежит имя Илья — русская форма библейского Илия. С древнееврейского это имя переводится как «мой Бог — Господь», то есть «мой Бог — Бог истинный». Однако вопрос в том, как именно из этого имени сделали фамилию Ильянис.

Самая вероятная версия — искусственное происхождение в семинарской среде. В XIX веке ученикам духовных училищ и семинарий нередко давали фамилии на -ис, -ус, -ий, переделывая русские или простонародные фамилии на более «учёный», книжный лад. Ильянис могла быть образована от фамилии Ильин или от отчества Ильинич по той же модели, что, например, Карамзин — от татарского «кара» или Разумовский — от прозвища Разум. Окончание -ис часто отсылает к греческому или латинскому влиянию, что было модно в среде православного духовенства. Значит, предок носителя фамилии, скорее всего, был либо священником, либо получил такую фамилию при поступлении в семинарию, чтобы отличаться от многочисленных Ильиных.

Менее распространённая, но возможная версия — литовское или польское происхождение. В литовском языке фамилии на -is (читается как «ис») — обычное дело. Фамилия Iljanis могла возникнуть от того же имени Илья, но уже в балтийской языковой среде. В таком случае предки носителя фамилии могли быть литовцами или поляками, жившими на территории бывшей Речи Посполитой. Однако для литовского языка более характерны фамилии на -aitis, -avicius, так что версия с искусственным семинарским происхождением выглядит правдоподобнее.

Географически фамилия редкая и встречается в основном в России и странах бывшего СССР, но без ярко выраженного регионального гнезда. Это тоже косвенно подтверждает «кабинетное» происхождение: такие фамилии не привязывались к конкретной местности, а разносились выпускниками семинарий по разным епархиям. Суффикс -ис в русской ономастике — явление не массовое, и Ильянис стоит в ряду таких же редких фамилий, как Адонис, Парфенис или Савватис.

Таким образом, основная версия: фамилия Ильянис — это искусственно созданная, книжная форма от имени Илья, которую получил предок-священнослужитель или семинарист. Значение имени-основы — «мой Бог — Господь» — подчёркивает религиозный подтекст, что полностью укладывается в контекст происхождения фамилии.