Фамилия Ильютко образована от имени Ильюта (Ильютка), которое представляет собой вариант мужского имени Илья. Крестильное имя Илья — видоизменённая форма библейского Eliyahu, с древнееврейского «мой Бог — Господь», то есть «мой Бог — Бог истинный». Но суть фамилии не в переводе, а в том, как это имя «обкаталось» в народной речи.

Ильютко — типичный пример восточнославянской модели, где к основе на -ют- добавляется уменьшительно-ласкательный суффикс -к- и окончание -о. Такая конструкция характерна для украинской и белорусской ономастики: она превращает личное имя в прозвище или фамилию, звучащую почти по-домашнему. Ильюта, Ильютка — так в быту могли называть мальчика или мужчину по имени Илья, чтобы подчеркнуть родство или простое происхождение.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским землям и Украине. Встречается в Гомельской, Брестской областях, а также на Сумщине и Черниговщине — там, где суффикс -ко особенно распространён. В России она редка, чаще всего у потомков переселенцев с этих территорий.

В отличие от фамилий на -ов или -ин, которые закрепились в основном у великорусского крестьянства и духовенства, Ильютко сохранила отпечаток более свободной, патронимической традиции: её носили не как «сын Ильи», а как «маленький Илья» или «Илья из нашей семьи». Это не дворянская и не купеческая фамилия — она из среды ремесленников, казаков или крестьян, где прозвище легко становилось наследственным.