Фамилия Иофин — одна из тех, что несут в себе сразу несколько слоёв истории: еврейскую ономастическую традицию, библейские корни и связь с известным раввинским родом. Её основа — прозвище или сокращённая форма имени Иофа. В первом случае она восходит к еврейскому слову «иоффа» (красивый) и могла характеризовать внешность родоначальника. Во втором — к библейскому имени Иофам, которое переводят как «Бог совершен»; Иофа в этом случае выступает как его обиходный вариант.

Фамилию образовали по распространённой у евреев модели с патронимическим суффиксом -ин, который в славянской среде указывал на принадлежность: Иофин — потомок Иофы. Такая схема типична для фамилий, сложившихся на территориях, где еврейское население контактировало с восточнославянской культурой, в частности в черте оседлости Российской империи.

Самый известный носитель родственной фамилии — раввин Мордехай Иоффе (1530–1612) из Праги, автор богословского труда «Левушим». Его дядя, Мозес Йофе, вёл родословную от рабби Самуэля бен Эльханана, правнука знаменитого толкователя Талмуда Раши. Это указывает на то, что фамилия Иофин, как и её варианты (Йофе, Иоффе), может восходить к потомкам уважаемых раввинских династий, хотя прямая связь каждой конкретной ветви требует отдельного генеалогического исследования.

В отличие от многих искусственных фамилий, которые в XIX веке массово присваивали евреям Австрийской и Российской империй (вроде Вейценбаум — «пшеничное дерево» или Цигенбаум — «козье дерево»), Иофин, скорее всего, старше. Он не составлен из немецких корней по указу чиновника, а образован естественным путём — от личного имени или прозвища. Это делает его более редким по происхождению: он не «придуман», а вырос из живого обихода.

Точное место и время возникновения фамилии Иофин установить сложно: процесс формирования еврейских фамилий растянулся на столетия и зависел от региона. Однако по своей модели — имя + славянский суффикс — она относится к пласту, который начал складываться ещё в XVI–XVII веках на землях Речи Посполитой.