Фамилия Исайчиков — один из тех случаев, когда отчество «застыло» в форме, выпадающей из привычного ряда. Большинство русских фамилий на -ов образованы от полных форм имен (Иванов, Петров) или прозвищ. Здесь же мы видим суффикс -ик, который в русском языке чаще образует уменьшительные или обиходные формы имени: Исай → Исайка → Исайчик. Фамилия Исайчиков — это буквально «сын Исайчика», то есть потомок человека, которого в быту звали уменьшительно-ласкательным Исайчик.

В основе лежит крестильное мужское имя Исай (Исаия). В переводе с древнееврейского оно означает «спасение Господне» и связано с библейским пророком Исайей. Имя было распространено в среде духовенства и среди крестьян, особенно в южнорусских и украинских землях. Фамилия образована по типичной для XVII–XIX веков модели: от обиходной формы имени прибавляли суффикс -ов, указывающий на принадлежность к роду. Сравните: Исайчиков — как Анисимчиков, Фомичев (от Фомич) или Кузьмичев.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным областям России, а также к Беларуси. В переписных книгах XVIII века встречаются крестьяне и однодворцы с фамилией Исайчиков в Курской и Воронежской губерниях. Это указывает на то, что носителями были не только священники (как можно было бы предположить из-за библейского имени), но и свободные землепашцы, а также служилые люди «по прибору».

Особенность фамилии — редкий суффикс -ик в основе, который не перешел в форму «Исайчиков» через отчество на -ич (как, например, Исаевич). Фамилия Исайчиков закрепилась именно в «простонародной» огласовке, минуя книжную форму. Это делает ее ценным маркером живой разговорной традиции: предка звали не строгим Исай, а домашним Исайчик, и это прозвище перешло в официальный документ.