Фамилия Искеева — редкий случай, когда географический корень почти наверняка перевешивает личное имя. Основа «иске» в тюркских языках, прежде всего в татарском и башкирском, означает «старый», «древний». Соответственно, Искеев — это «сын старого», но не в смысле возраста, а как указание на место: Искеево, Искеев — типичный ойконимический топоним, то есть фамилия, образованная от названия населённого пункта.

В Татарстане и Башкортостане есть несколько деревень с корнем Искеево (например, в Актанышском районе Татарстана). Житель такой деревни получал прозвище Искеев, а его потомки закрепили его как фамилию. Суффикс «-ев» здесь — русский патронимический формант, который в XIX–XX веках массово присоединяли к тюркским основам при оформлении фамилий в документах. Форма Искеева — женский вариант, образованный по той же модели.

Менее вероятна, но возможна версия от личного имени Искей — уменьшительной формы от Исхак (через Исак → Искай). Однако для такой гипотезы нет надёжных письменных подтверждений, и она уступает топонимической по частоте встречаемости. В любом случае, корень «иске» указывает на связь с тюркской средой Поволжья и Приуралья.

Фамилия довольно редкая. По открытым данным переписей, основная масса носителей сосредоточена в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области. Встречается также у казахов (форма Искеев), что подтверждает общность тюркской основы. Социальный состав предков — скорее всего, государственные крестьяне или тептяри, то есть нерусское население, платившее подати, но не приписанное к помещикам. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.