Фамилия Искин, скорее всего, образована от уменьшительной формы личного имени Исаак. В русской народной традиции это имя, пришедшее из древнееврейского (означает «смеющийся»), нередко сокращали до Иска, Ися, Иса. От таких обиходных форм с помощью суффикса -ин и возникла фамилия Искин, буквально означающая «сын Иски» или «потомок Иски».

Суффикс -ин в данном случае указывает на принадлежность: чей? — Искин. Это одна из самых распространённых моделей образования русских фамилий (сравните: Пушкин, Бородин, Ильин). Основа «Иск-» могла возникнуть в результате усечения полного имени, что типично для бытовой речи. Менее вероятная, но возможная версия — связь с прозвищем Иска от глагола «искать» (например, сыщик или дотошный человек), однако антропонимические словари (например, работы Б. Унбегауна) указывают на преобладание версии от имени.

Географически фамилия Искин встречается в центральных и северных областях России, а также в Поволжье, что совпадает с зоной распространения крестильных имён в их народных формах. Интересно, что в некоторых говорах слово «иска» означало «искра» или «огонь», но эта версия остаётся гипотетической — скорее всего, перед нами именно отчество, а не прозвище по ремеслу или внешности.

Однокоренные фамилии — Исаков, Исаев, Искандеров — имеют иное происхождение. Искин стоит особняком именно благодаря редкой усечённой основе, что делает её интересным примером народной трансформации церковного имени.