Фамилия Искинов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить случайные совпадения, её корень, скорее всего, не славянский, а тюркский. В основе лежит личное имя Искин. В татарском, башкирском и казахском языках есть слово «иске» (старый, древний), а также имя Искандер (Александр). Имя Искин могло быть либо самостоятельным прозвищем («старик», «старейшина»), либо сокращённой формой от того же Искандера (через промежуточное «Искан»). Русский суффикс -ов указывает на принадлежность: Искинов — «сын Искина». Так фамилия закрепилась в русской среде, вероятнее всего, у обрусевших татар, башкир или представителей других тюркских народов Поволжья и Приуралья.

Словообразовательная модель здесь классическая: основа Искин + патронимический суффикс -ов. Это говорит о том, что фамилия возникла не в дворянской среде, а в крестьянской или мещанской, где отчество на -ов становилось наследственным. Встречается фамилия в основном в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — в зоне исторического расселения татар и башкир. В дореволюционных документах могла писаться через «а» — Искинав, если фиксировалась в тюркоязычной записи, но в русских метрических книгах устоялось написание через «о».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с географическим названием. В России есть несколько топонимов Искино (например, в Новосибирской области). Переселенцы, получившие фамилию по названию места жительства, могли стать Искиновыми. Но эта версия слабее: обычно топонимические фамилии оформляются суффиксами -ский/-ской (Искинский), а не -ов. Поэтому основная гипотеза — от личного имени Искин, и фамилия эта — живое свидетельство многовекового соседства и смешения славянских и тюркских культур.