Фамилия Иванчишина образована от редкой народной формы имени Иван — Иванчиша. Каноническая форма этого имени — Иоанн, в переводе с древнееврейского оно означает «милость Божья». Фамилия строится по стандартной для русской ономастики модели: к основе Иванчиш- добавляется суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Иванчишин), и затем родовое окончание -а, характерное для женской формы фамилии. Таким образом, Иванчишина буквально значит «жена или потомок Иванчиши».

Имя Иван было самым распространённым на Руси, поэтому от него возникло огромное количество производных форм — как ласкательных (Ваня, Ванечка), так и пренебрежительных или просторечных (Иванчиша, Иванюта). Форма на -чиша встречается нечасто, что делает фамилию локально узнаваемой. Скорее всего, основатель рода Иванчишиных был человеком из простого сословия: в крестьянской и посадской среде именно такие «домашние» варианты имени часто становились основой для фамилии, в то время как дворянские роды предпочитали полные канонические формы.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России, где суффикс -ин особенно распространён. Встречается она и в украинском варианте Иванчишин, но с другим окончанием. Анализ словообразовательной модели показывает, что перед нами типичный пример «полуотчества»: фамилия закрепилась не от имени отца (Иван), а от его обиходного прозвища (Иванчиша), что характерно для позднего этапа формирования русских фамилий в XVI–XVII веках.