Фамилия Иванисовы (в мужском роде — Иванисов) образована от разговорной формы крестильного имени Иван. В основе лежит не само имя, а его производная форма — Иванис. Такие варианты, как Иванис, Иваниш, Иванич, возникали в народной среде как ласкательные или обиходные варианты канонического имени Иоанн, которое в переводе с древнееврейского означает «милость Божья».

Словообразовательная модель здесь необычна. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев (Иванов) или -ин (Иванин), фамилия Иванисов использует суффикс -ис, который в русской ономастике встречается реже. Этот суффикс мог появиться под влиянием украинской или белорусской традиции, где формы на -ис (Иванис, Грицис) более характерны. Со временем к основе Иванис добавился типичный русский патронимический суффикс -ов, что дало фамилию Иванисов — «сын Иваниса». Такое двойное оформление (сначала уменьшительно-ласкательная форма, затем отчество) указывает на то, что фамилия могла сложиться не в центральных великорусских землях, а на западных или южных окраинах, где пересекались разные языковые традиции.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно, но её структура подсказывает вероятный регион. Фамилии с суффиксом -ис и последующим -ов характерны для территорий, где смешивались русское и украинское население — например, для Слобожанщины, юга России или бывших пограничных областей. В официальных документах такие фамилии фиксировались позже, чем простые Ивановы, что объясняет их меньшую распространённость.

Важно не путать Иванисовых с фамилией Иванищев: суффикс -ищ- указывает на крупный размер или пренебрежение (Иванище — «большой Иван»), тогда как -ис — на ласкательное или уменьшительное значение. Таким образом, предок носителей фамилии Иванисовых мог быть младшим в роду или же просто носить народный вариант имени, который закрепился в документах как фамильное прозвище.