Фамилия Ивантишена — редкий случай, когда женская форма закрепилась в документах как основная, хотя по правилам русской ономастики она должна была бы быть вариантом к мужской Ивантишен. Встречается почти исключительно на юге России и в украинских областях, что сразу указывает на её вероятное происхождение из западнорусских или малороссийских земель.

В основе фамилии лежит каноническое имя Иван (от древнееврейского Йоханан — «Бог помиловал»). Но здесь мы видим не стандартную русскую модель «Иван → Иванов», а цепочку с уменьшительно-ласкательным суффиксом -иш-. В славянской антропонимии суффикс -иш- придавал имени оттенок пренебрежительности или, наоборот, фамильярной ласки, как в словах «парниша», «домище». Сочетание с суффиксом -ен- (Ивантишен) характерно для украинской и белорусской традиции: так образовывали фамилии от прозвищ или патронимов, оканчивающихся на -иш. Получается, что Иван → Ивантиш (прозвище вроде «Иванище» или «Иванишка») → потомок Ивантиша → Ивантишен.

Сам суффикс -ен в фамилиях (как в Ивантишен, Тимошенко, Даниленко) — типичный признак украинского патронимического строя, где он указывает на сына или потомка. В русском языке аналогичную роль играл суффикс -ов/-ев. Поэтому Ивантишена — это не «жена Ивантиша» (хотя по форме так и есть), а скорее «дочь или вдова из рода Ивантишеных». В XIX веке при переписях женские фамилии часто записывали именно в такой форме, если женщина была главой двора или вдовой, и позже она закрепилась как неизменяемая.

Учитывая редкость фамилии, её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких близких гнёзд — например, из бывших казачьих станиц или сёл Черниговщины, Полтавщины, а также из переселенческих районов Кубани. Прозвище Ивантиш могло закрепиться за человеком, которого в округе звали «Иванище» — возможно, за крупного или медлительного мужчину, либо за того, кто постоянно поминал имя Иван всуе. Другая, менее вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «ивантить» (в некоторых говорах — «шататься без дела»), но она не подкреплена письменными источниками.

В целом фамилия Ивантишена — яркий пример того, как украинская словообразовательная модель (суффикс -ен) и русская грамматическая форма (женское окончание -а) слились в одном написании, сохранив для потомков память о прозвище их предка-Ивана.