Фамилия Ивануткин образована от краткой формы имени Иван — Иванутка. В русской народной традиции имя Иван, самое распространённое на Руси, породило десятки уменьшительных вариантов: Ивашко, Ваня, Ванюта, Ванятка, Иванушка и, в том числе, Иванутка. Суффикс -ут(а) в этом имени носит ласкательный, бытовой оттенок. Такие формы часто встречались в северных и центральных губерниях, где любили «усекать» полное имя, добавляя к основе суффикс с гласной у.

Фамилия строится по простой патронимической модели: основа Иванутк- плюс суффикс -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — «Ивануткин», то есть сын, потомок Иванутки. Это типичный для русских фамилий способ образования от имён, оканчивающихся на -а, -я. В отличие от фамилий на -ов (от основ на твёрдый согласный), здесь использован именно «материнский» суффикс, хотя речь идёт об отце.

Интересная деталь: фамилия Ивануткин встречается реже, чем Иванов или Ванин, но её география довольно стабильна. По данным переписей и телефонных справочников, основное ядро носителей сосредоточено в Поволжье, особенно в Нижегородской области и в Чувашии. Это неудивительно: именно в этих регионах в XVII–XVIII веках активно бытовали уменьшительные формы имён на -утка, -утя. Возможно, предок носителя фамилии был крестьянином или посадским человеком, которого в документах записали не полным именем, а домашним прозвищем — Иванутка.

Словообразовательная модель здесь прозрачна, и спорных версий почти нет. Иногда пытаются связать фамилию с диалектным словом «иванутка» (вид растения или птицы), но такая гипотеза слаба: ни один из известных словарей русских говоров не фиксирует подобного значения. Гораздо правдоподобнее, что перед нами обычная патронимическая фамилия от имени, которое в XIX веке уже вышло из обихода в качестве самостоятельного, но закрепилось в фамилии как память о конкретном человеке — Иванутке.