Фамилия Кафисов образована от мужского имени Кафис. Оно, вероятнее всего, является диалектным вариантом мусульманского имени арабского происхождения Хафиз, в основе которого лежит арабское hafis, т.е. «воин, защитник, удерживающий». Вероятнее всего, родители нарекая ребёнка именем Кафис, надеялись, что в будущем их отпрыск сможет показать себя храбрым, сильным, отважным мужчиной. Таким образом, потомок человека, которого звали Кафис, со временем получил фамилию Кафисов.