Фамилия Какухина — женская форма фамилии Какухин, и её разговорный вариант может показаться необычным, но за ним стоит вполне прозрачная словообразовательная модель. Фамилия образована с помощью типичного русского суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Какухин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Какуха.

Само прозвище Какуха, скорее всего, восходит к диалектному слову «какуха» или «какушка». В русских говорах так могли называть кукушку — птицу, известную своим голосом. В ономастике прозвища, данные по птицам, — распространённое явление: Соловей, Воробей, Сокол. Кукушка в народной культуре часто ассоциировалась с одинокой женщиной, вдовой или, в ироничном ключе, с человеком, который «кукует» — то есть однообразно говорит или жалуется. Однако не исключено, что прозвище дали по внешнему сходству: например, за пёструю одежду или характерную позу.

Вторая, менее вероятная, версия связывает основу с тюркскими корнями. В некоторых тюркских языках есть слово «каку» (например, в значении «сухой», «высохший»), но для фамилии Какухин такое объяснение звучит натянуто: суффикс -ин — исконно русский, а тюркские основы обычно получали суффикс -ов/-ев. Поэтому версия с «кукушкой» выглядит убедительнее.

Географически фамилия Какухин встречается редко и локализована преимущественно в центральных и северных областях России, где диалектное слово «какуха» было в ходу. В письменных источниках XVII–XVIII веков подобные прозвища фиксировались среди крестьян и посадских людей — то есть предки носителей фамилии, скорее всего, были из непривилегированных сословий, получивших фамилию по уличному прозвищу.

Таким образом, фамилия Какухина — это память о прозвище предка, которого в деревне за что-то прозвали Кукушкой. Точное значение ускользает, но круг возможных смыслов ясен: либо по птице, либо по манере поведения.