Фамилия Калабердина образована от личного имени Калаберда, а оно, в свою очередь, восходит к двум тюркским основам: kala («город») и berdi («он дал»), перфектной форме глагола bermek («давать»). Дословно имя Калаберда переводится как «данный городом». Это типичная для тюркской ономастики модель сложения двух слов в одно, причем вторая часть — «берды» — широко распространена в именах (вспомните хотя бы Бердымухаммеда). Заметим, что фамилия сохранила женскую форму на -а, свойственную русским фамилиям на -ин: Калабердина — «дочь или жена Калаберды».

Корень «кала» в значении «город» встречается и в других фамилиях, например, Калашников (от «калач»), но здесь связь прямая и географическая. Скорее всего, прозвище Калаберда давали человеку, который либо родился в городе, либо был отдан городу — возможно, на службу или в учение. В тюркской среде такие имена часто носили оберегающий или посвятительный характер.

Модель образования фамилии через суффикс -ин указывает на то, что предок носителя фамилии жил в русскоязычной среде, вероятно, на границе с тюркскими землями или в регионах с сильным татарским влиянием — например, в Поволжье или на Урале. Фамилия редкая, и встретить её можно преимущественно в этих краях. В отличие от распространённых фамилий вроде Иванова, Калабердина не теряет связи с исходным прозвищем: она буквально рассказывает, кем был основатель рода — человеком, которого город «дал» или которому город был дан.

В словарях тюркских заимствований в русском языке эта фамилия не фиксируется как нарицательное слово, но её прозрачная внутренняя форма не оставляет сомнений в происхождении. Так и представитель рода Калабердиных может по праву гордиться своей фамилией как ценным источником семейной истории: передаваясь из поколения в поколение, фамилия по сей день хранит память о происхождении человека.