Фамилия Калабынина — женская форма, а мужская, Калабынин, образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: чей? — Калабынин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Калабыня.

Основа фамилии — прозвище Калабыня. Перед нами не самый очевидный случай, и тут возможны два основных объяснения. Первое: корень «калаб-» может быть связан с диалектным глаголом «калабать» — стучать, колотить, или с «калабухой» — колотушкой, деревянным молотком. В таком случае Калабыней могли прозвать плотника, бондаря или просто человека с тяжелой рукой, любителя постучать. Второе, более распространенное в русской ономастике объяснение: связь с тюркским «калаба» или «калабай» — беспорядок, суматоха, ссора. Прозвище могло закрепиться за неуживчивым, сварливым человеком, забиякой. В пользу тюркского следа говорит и то, что фамилия Калабынин встречается в регионах, где исторически было сильное татарское или башкирское влияние — например, в Поволжье и на Урале.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от полных имен (Иванов), форма на -ин в данном случае однозначно отсылает к прозвищу, а не к крестильному имени. Калабыня — это не уменьшительное от канонического имени, а самостоятельная характеристика человека. Социально фамилия Калабынин, скорее всего, крестьянская или посадская, без дворянского корня — такие прозвища редко закреплялись за высшими сословиями.