Фамилия Калгин образована от прозвища Калга. Исходное слово многозначно, и единой версии его происхождения нет — перед нами случай, когда в одной фамилии могли пересечься разные языковые и культурные традиции.

Самая прозрачная версия — русская, диалектная. В северных говорах «калгой» называли грубую деревянную чашку, вытесанную топором, в отличие от точёной посуды. Соответственно, Калгой могли прозвать мастера, который такую посуду делал. В архангельских говорах у того же слова было другое значение — «голые лыжи, не подбитые мехом (камысами)». В этом случае прозвище закрепилось за человеком, который ходил на таких лыжах, или за тем, кто их мастерил.

Однако есть и тюркская версия. В Крымском ханстве калгой называли второе по значимости лицо после хана. Должность калги ввёл хан Менгли I Герай, и назначали на неё обычно брата или сына правящего хана. Резиденция калги находилась в Акмесджите (нынешний Симферополь). Это значение — титул, а не ремесло, и если прозвище пришло оттуда, то его носитель мог быть выходцем из татарской среды или иметь отношение к ханскому двору.

Выбрать одну версию сложно. В пользу русской диалектной основы говорит ранняя письменная фиксация: в 1627 году в Белёве записан крестьянин Калга Трофим. Для русской деревни титул крымского вельможи — маловероятное прозвище, а вот прозвище по занятию или предмету обихода — обычное дело. Поэтому наиболее правдоподобно, что фамилия Калгин восходит к прозвищу мастера по дереву или лыжника, а тюркское значение — скорее совпадение, хотя и не исключённое для южных регионов.

Фамилия образована стандартным для русского языка суффиксальным способом: притяжательный суффикс -ин указывает на принадлежность потомку человека по прозвищу Калга. Встречается фамилия в разных регионах, но явной географической привязки к одному ареалу нет.