Фамилия Калиберда ведет свою родословную из тюркского мира. Ее основа — это сращение двух слов: «кала» (город) и «берди» (он дал). Вторая часть представляет собой перфектную форму глагола «бермек» — «давать». Полностью конструкцию можно перевести как «город дал» или «дарованный городом». Позже корень «берди» стал самостоятельным мусульманским мужским именем Берди, которое в татарской традиции осмыслялось как «божий дар».

Словообразовательная модель здесь необычна для славянских фамилий: фамилия не получила русского суффикса (-ов, -ин, -ский), а осталась в виде чистого тюркского композита. Такое явление характерно для фамилий, которые зафиксировали прозвище или личное имя в его исходной, неадаптированной форме. Носители Калиберда — это, скорее всего, потомки человека, которого в русскоязычной среде записали по прозвищу, данному за связь с городом: возможно, он был выходцем из города, городским жителем или получил надел от городской общины.

В ономастических трудах, например, в работах по тюркско-русским контактам, подобные фамилии разбирают редко, но модель «кала + берди» встречается в антропонимии татар, башкир и народов Средней Азии. В русском бытовании фамилия Калиберда — редкий случай, когда тюркская основа не обросла славянским окончанием, что делает её ценной для историков языка. Географически такие фамилии чаще всего привязаны к регионам бывшего Казанского ханства, Заволжья и южнорусских степей, где тюркские и славянские традиции активно смешивались.