Фамилия Калимулин образована от арабского имени Калимулла. Это составное имя: первая часть «калим» означает «собеседник» или «говорящий», вторая — «улла» — родительный падеж от слова «Аллах». Вместе имя Калимулла переводится как «разговаривающий с Богом» или «изрекающий слово Божье». В исламской традиции Калимулла — один из эпитетов пророка Моисея, что придаёт имени особый религиозный вес.

Фамилия построена по типичной для тюркских и кавказских народов модели: к основе имени добавляется русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?»). То есть Калимулин — это «сын Калимуллы» или «потомок Калимуллы». В быту имя Калимулла обросло диалектными сокращениями — Кали, Каляй, Калкай, Калюк, поэтому фамилия могла закрепиться и от одной из этих форм.

Нарекая сына именем Калимулла, родители желали ему быть достойным мусульманином, что естественно для традиционного общества, где религия определяла жизненный уклад. Фамилия распространена среди татар и башкир, реже встречается у казахов. Известный носитель — Тимержан Мидхатович Калимулин (р. 1961), мастер спорта международного класса по греко-римской борьбе, чемпион Европы 1986 года и обладатель Кубка мира 1985 года.