Фамилия Калимулина образована от мужского мусульманского имени Калимула. Это имя арабского происхождения, и его смысл — «разговаривающий с Аллахом», «изрекающий слово Божье». Нарекая сына Калимулой, родители желали ему стать достойным мусульманином, что в традиционном обществе с огромной ролью религии было естественным и важным пожеланием.

В основе фамилии лежит модель, характерная для тюркских и кавказских народов, исповедующих ислам: к имени отца добавлялся русский суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?»). Таким образом, Калимулин — это «потомок Калимулы». Со временем эта форма закрепилась как наследственная фамилия и передавалась из поколения в поколение, храня память о родоначальнике.

Имя Калимула — не единственное в ряду подобных. В той же среде бытовали имена Халимулла (милосердный раб Аллаха), Сабирулла (терпеливый раб Аллаха) и другие, от которых позднее образовались фамилии Халимуллин, Сабируллин. Фамилия Калимулина стоит в этом же ряду, и её носители могут проследить связь с одним из таких «божественных» имён.

Встречается фамилия в основном в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской и башкирской диаспоры в других регионах России. Иногда можно увидеть вариант написания с двумя «л» — Каллимулина, но он менее распространён и, скорее всего, является результатом искажения при записи в документах. Основная и исторически верная форма — с одной буквой «л» в корне.