Фамилия Калинаева — женская форма, мужская — Калинаев. Её основа — слово «калина», но не всё так прозрачно, как кажется. Самый очевидный путь: прозвище Калинай или Калинайка могли дать человеку с румяным, красным лицом, как спелая ягода. В русских говорах «калиной» называли не только кустарник, но и цвет, и даже горечь — отсюда возможен и переносный смысл: угрюмый, «горький» человек.

Однако суффикс -аев здесь нестандартный. В фамилиях на -аев обычно прячется тюркская основа: например, Каратаев от «кара тай» — «черный жеребенок». Но «Калина» — слово славянское, и -аев могло возникнуть из-за местного произношения: в некоторых говорах фамилии на -аев писали вместо -еев, если основа оканчивалась на мягкий согласный. То есть первоначально могло быть Калинаев от Калинай, а не от Калина.

Есть и другая версия: фамилия образована от имени Калина — это народная форма крестильного имени Каллиник (от греческого «прекрасная победа»). В таком случае Калинаев — притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?»: сын Калины. Эта модель (основа на -а + суффикс -ев) редка, но встречается в северных и центральных областях России.

Географически фамилия Калинаева встречается нечасто, в основном в Поволжье и на Урале. В архивных записях XVII–XVIII веков её не найти — скорее всего, она оформилась поздно, в среде крестьян или однодворцев. Точных данных о сословной принадлежности нет, но суффикс -ев указывает на русское происхождение, а не на дворянское.

Если суммировать: Калинаев — это либо «сын Калины» (от имени или прозвища), либо вариант фамилии Калинаев, где -аев закрепилось из-за диалекта. В любом случае, корень связан с калиной — ягодой, которая в народной культуре символизирует и красоту, и горечь.