Фамилия Каллее — редкая и неочевидная. Её звучание и написание сразу наталкивают на мысль об иноязычном происхождении, и это первое, что стоит проверить. С точки зрения русской ономастики, фамилия явно не вписывается в типичные модели на -ов, -ин или -ский, что сужает круг поиска.

Самый вероятный корень — немецкий или прибалтийский. Фамилия могла возникнуть от немецкого слова «Kalle» — уменьшительной формы имени Карл (Karl). В этом случае суффикс -ее (в оригинале -ee) — это типичное для немецких фамилий окончание, указывающее на принадлежность или происхождение (как в фамилиях типа Bodee, Ahrendsee). Так образовались фамилии у балтийских немцев или у переселенцев в Российскую империю в XVIII–XIX веках. Если предок носил прозвище Kalle (Карлуша), то его потомки могли получить фамилию Kallee — «из рода Карла».

Вторая версия — финская. В финском языке слово «kalle» означает «дорогой, ценный», а также является частью сложных имён (Kalle, Kallela). Финские фамилии нередко заканчиваются на -ее или -аа, и Каллее могла быть русифицированной записью финской фамилии Kallee или Kalle. Это особенно вероятно для территорий бывшей Выборгской губернии или Ингерманландии, где финское население было многочисленным.

Третья версия, менее распространённая, — от тюркского имени Кали (как вариант Калиулла) с последующей адаптацией через -ее. Но в таком случае фамилия скорее сохранила бы суффикс -ев (Калиев), поэтому этот путь маловероятен.

География фамилии Каллее в России крайне узкая. По данным открытых источников, основные носители встречаются в Санкт-Петербурге и Ленинградской области, а также в Карелии. Это косвенно подтверждает финскую или прибалтийско-немецкую гипотезу: именно в этих регионах исторически оседали выходцы из Финляндии и Прибалтики.

Сословная принадлежность носителей фамилии не зафиксирована в массовых ревизских сказках, что говорит о её позднем закреплении (вероятно, в конце XIX — начале XX века) или о малочисленности рода. Скорее всего, предки были городскими обывателями, ремесленниками или мелкими торговцами, а не дворянами или крестьянами.

Итог: фамилия Каллее — не русская по происхождению. Она пришла либо из немецкого языка (как производная от имени Карл), либо из финского (от слова «дорогой»). Наиболее правдоподобна финская версия с учётом географии бытования.