Фамилия Калонов образована от личного имени Калон. В таджикском языке это имя означает «великий», и оно до сих пор встречается в Таджикистане и Узбекистане. Слово «калон» в близком значении бытует и за пределами Средней Азии: на Тибете калонами называли министров. Таким образом, Калонов — это потомок человека, которого звали Калон.

Словообразовательная модель здесь необычна для русской фамилии. Суффикс -ов типичен для русского патронима («чей?»), но основа «Калон» не славянская. Это говорит о том, что фамилия возникла на стыке культур: русская административная система фиксировала местные имена по привычной модели «имя + -ов». В результате человек с именем Калон записывался как Калонов — его сын или потомок.

Встречается и тюркский вариант оформления той же основы, с корнем -оглы (в переводе «сын, потомок»). Он типичен для турецких, гагаузских и других тюркских фамилий, но в русском документообороте чаще закреплялся именно суффикс -ов. Поэтому Калонов — это, скорее всего, оседлый вариант фамилии, записанный по русской канцелярской традиции.

Географически фамилия тяготеет к Средней Азии, особенно к Таджикистану и Узбекистану. Встречается она редко, и её носители — потомки людей, чьё имя или прозвище подчёркивало величие, высокое положение или уважение.