Фамилия Калунин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: от прозвища или имени, оканчивающегося на -а, с помощью патронимического суффикса -ин. В основе лежит личное имя или прозвище Калуня. Чтобы понять, что оно означало, нужно разобраться с корнем.

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «калун». В северных и сибирских говорах так называли плотный туман, мглу, а также — человека, который ходит будто в тумане, рассеянного или медлительного. Прозвище Калуня могли дать нерасторопному, сонному человеку. В этом случае фамилия относится к группе «характерологических» — тех, что описывают поведение или внешность предка.

Менее распространённая, но имеющая право на существование версия — связь с гидронимом Калунка (река в бассейне Оки) или с названием населённого пункта вроде Калунино. Такие топонимические фамилии обычно оформляются суффиксом -ский (Калунский), но в народной среде возможны и упрощения. Однако для фамилии Калунин эта версия слабее: большинство носителей фамилии исторически фиксируются в центральных и северных губерниях, а не в местах с рекой Калунка.

Обратите внимание на редкую черту: суффикс -ин при основе на -а — стандартная схема, но само прозвище Калуня звучит как ласкательная или уменьшительная форма. Это значит, что предка могли звать не просто Калун, а именно Калуня, что подчёркивает бытовой, неофициальный характер прозвища. В официальных переписях XVII–XVIII веков такие формы встречаются у крестьян и посадских людей — фамилия явно недворянская, скорее всего, из крестьянской или мещанской среды.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) Калунин не упоминается в числе самых ходовых, что говорит о его сравнительной редкости. Поиск по современным базам показывает, что фамилия встречается в основном в центральной России и Поволжье, с небольшим «пятном» в Архангельской области — что косвенно подтверждает северный диалектный корень.