Этимология фамилии Колунин, принадлежащей к распространенному типу финно-угорских фамилий, восходит к имени собственному. Фамилия Колунин образована от имени Колуна. Вероятно, оно произошло от слова «колана», которое в переводе с языка коми имеет значение «нужный». Скорее всего, так назвали долгожданного ребенка. Кроме этого, имя Колуна могло восходить к комяцкому глаголу «кольны» в значении «оставить; бросить, покинуть». В этом случае подобное имя, возможно, получил младенец, которого оставили родители. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Колуна, со временем получил фамилию Колунин.