Фамилия Калыкова — женская форма, мужской вариант — Калыков. В основе фамилии лежит личное имя Калык, которое может быть как тюркским, так и календарным русским, что создаёт две версии происхождения.

Первая и наиболее вероятная версия — тюркская. Имя Калык (от тюркского «калык» — народ, люди, племя) было распространено у башкир, татар, казахов. В таком случае фамилия Калыков означает «принадлежащий к народу» или «сын народа». Суффикс -ов указывает на русскую модель оформления тюркских фамилий, типичную для Поволжья и Урала: в XVI–XIX веках при переходе в православие или при переписях тюркские имена получали русское патронимическое окончание.

Вторая версия — русская, но более редкая. Калык — это народная форма канонического имени Каллиник (от греческого «каллос» — красота и «нике» — победа, то есть «прекрасный победитель»). В русских говорах имя Каллиник сократили до Каллик, а затем до Калык. Такая фамилия могла возникнуть в среде старообрядцев или крестьян центральной России, где ценили просторечные варианты церковных имён. Однако эта версия слабее: если бы фамилия была русской, она чаще встречалась бы в центральных губерниях, тогда как Калыковы компактно живут в Башкортостане, Татарстане и Оренбуржье — на стыке тюркского и русского миров.

География фамилии подсказывает социальный контекст. В XIX веке Калыковы числились среди государственных крестьян и тептярей (сословие, сочетавшее тюркские и финно-угорские корни). Это были не дворяне и не купцы, а люди, занятые земледелием и скотоводством. Фамилия не получила широкого распространения за пределами Урало-Поволжья, что подтверждает её локальный характер.

Редкая деталь: у фамилии Калыкова есть омонимичная форма в казахском языке, где «калык» — «народ», но суффикс -ов там нехарактерен для исконно казахских фамилий. Поэтому казахские Калыковы — это, скорее всего, потомки татар или башкир, переселившихся в Казахстан в советское время.