Фамилия Калыков — из тех, где ясна словообразовательная модель, но неочевидна основа. Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую форму: Калыков — это «сын Калыка». Но вот что такое «Калык» — вопрос, на который есть две версии, и обе имеют право на существование.

Первая и самая распространённая гипотеза связывает фамилию с тюркскими корнями. В казахском, башкирском, татарском языках слово «калык» (или «калыҡ») означает «народ», «люди». В этом случае прозвище Калык мог получить человек, которого считали выразителем народной воли, либо тот, кто имел много детей, был главой большого рода. Однако прямое именование «народ» в качестве прозвища встречается редко — скорее это было ласкательное или уважительное обращение, которое закрепилось как имя. В пользу тюркской версии говорит география: фамилия Калыков распространена среди башкир, татар, казахов, а также в смешанных регионах Поволжья и Урала.

Вторая версия — русская разговорная. В диалектах русского языка (особенно северных и сибирских) «калык» — искажённая форма слова «калека», то есть немощный, увечный человек. Прозвище Калык могли дать человеку с физическим недостатком. Но здесь важно уточнить: в документах XVI–XVII веков встречается и фамилия Калыков, и фамилия Калекин, причём обе образованы от одного корня. Бытовая фонетика часто заменяла «е» на «ы» в безударном положении, так что «калык» и «калека» — варианты одного слова. Эта версия менее популярна у исследователей, но имеет под собой реальную лексическую основу.

Какую из гипотез считать основной — зависит от региона. В среде, где преобладает тюркская речь, логичнее видеть в основе «народ». В русскоязычной среде — «калеку». Интересно, что фамилия не получила широкого распространения в центральной России, а сосредоточена в зонах тюркско-славянского пограничья, что склоняет чашу весов в пользу первой версии. Фамилия Калыков — не дворянская и не купеческая, а крестьянская или казачья, что подтверждается её патронимическим форматом и отсутствием в родословных книгах.