Фамилия Кандыкбаева — редкий пример фамилии, в которой соединились тюркская основа и русский суффикс, и при этом она почти не встречается за пределами определённого региона. Её носительницы (а это женская форма) или их предки-мужчины (носившие вариант Кандыкбаев) происходят, скорее всего, из Средней Азии или прилегающих областей, где были распространены тюркские языки.

Разберём основу «Кандык». В тюркских языках, в частности в казахском и киргизском, слово «кандык» имеет несколько значений. Самое прямое — «кровавый» (от «кан» — кровь). Но в ономастике такое прозвище вряд ли давали за жестокость. Скорее, это мог быть компонент составного имени. Вторая версия: «кандык» — это название растения (кандык — это сибирский вид лилии или луковичное растение, Erythronium). Третья, и самая правдоподобная для фамилии, — «Кандык» могло быть личным именем или прозвищем, образованным от тюркского «кан» (кровь, род) и суффикса «-дык», что могло означать «кровный», «родной», «единокровный». То есть прозвище могло указывать на принадлежность к роду, на близкое родство.

Суффикс «-баев» — типичный для многих тюркских фамилий в России и Средней Азии. Он восходит к слову «бай» — богатый, хозяин, господин. В составе фамилий «-баев» часто указывал на родоначальника, которого звали, например, Кандыкбай. То есть полное мужское имя предка могло звучать как Кандыкбай — «кровный (родной) богач» или «богач по имени Кандык». Затем, по русской модели, от имени Кандыкбай образовали фамилию Кандыкбаев (чей? — сын Кандыкбая), а женская форма Кандыкбаева появилась как естественное производное.

Географически фамилия тяготеет к южным регионам бывшего СССР: Казахстан, Киргизия, возможно, Узбекистан. В России она встречается редко, в основном у потомков переселенцев или смешанных семей. Интересно, что в отличие от многих фамилий на «-баев», где основа очевидна (например, Ахметбаев), здесь корень «Кандык» неочевиден для носителя русского языка и создаёт ощущение загадочности. Однако этимология прозрачна: перед нами типичная патронимическая фамилия, образованная от составного тюркского имени с уважительным компонентом «бай».