Фамилия Кандзёба — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней сразу бросается в глаза необычный финал -ёба, который нехарактерен для стандартных русских фамилий на -ов/-ев или -ин. Это указывает на то, что перед нами, скорее всего, фамилия невеликорусского происхождения, а украинская или белорусская.

Самый вероятный путь разбора — через основу «кандзёб-». В украинском языке есть слово «кандзюба» или «кандзьоба» — так в некоторых говорах называют кривое, корявое дерево, сучковатый ствол или просто что-то несуразное, искривлённое. Соответственно, прозвище Кандзёба могли дать человеку с характерной внешностью (например, сутулому или с искривлённой ногой), либо же обладателю тяжёлого, «кривого» нрава. Суффикс -ёба в данном случае — это не уменьшительная форма, а часть корня, которая в украинской фонетике закономерно перешла в «ё» (сравните: «дьоготь» — дёготь).

Версия о происхождении от японского или другого восточного имени (где «Кандзё» — имя, а «ба» — место) маловероятна. Фамилия Кандзёба не встречается в японских списках, а на славянской почве она имеет чёткую словообразовательную модель: прозвище + типичное для украинских фамилий окончание, которое в русской записи закрепилось как -а. Если бы фамилия была русской по модели, она звучала бы как Кандзёбов.

Географически фамилия тяготеет к западноукраинским и польским землям. В польском языке есть схожее слово «kędzioba» (с носовым звуком) — со значением «косматый», «лохматый». Это ещё один возможный корень: прозвище могло относиться к человеку с неопрятной, всклокоченной шевелюрой. Таким образом, у фамилии Кандзёба есть два равноправных объяснения — «кривой» или «косматый», и оба восходят к внешним, бросающимся в глаза чертам предка.