Фамилия Канноев — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает любые другие версии происхождения. Если отбросить маловероятные варианты, связанные с искажением тюркского слова «кан» (кровь) или прозвища от глагола «кануть», то остаётся одно объяснение: фамилия образована от названия населённого пункта Канное. Такие топонимы встречаются в Латвии и Эстонии, и именно оттуда, скорее всего, происходит родоначальник.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная. Основа Канно- плюс суффикс -ев, который в русском языке типичен для фамилий, образованных от географических названий, оканчивающихся на -о, -е или мягкий согласный. Канноев — буквально «выходец из Канное». Это ставит фамилию в один ряд с такими, как Ростовцев, Вяземский или, скажем, Таллиннов, хотя последняя и не встречается. Суффикс -ев указывает на принадлежность, на связь с местом, а не на отчество.

Исторический контекст тоже важен. Прибалтийские губернии Российской империи, особенно Курляндия и Лифляндия, были регионом, где русские фамилии нередко возникали у крестьян или мещан, переселившихся из центральных областей или получивших землю. Владелец мызы или арендатор мог получить прозвище по названию хутора или деревни. В случае с Канноевыми это мог быть эстонец или латыш, чья фамилия была русифицирована при записи в метрические книги, или же русский, долго живший в тех краях.

С точки зрения сословной принадлежности, Канноевы, скорее всего, не относились к дворянству. Такие «географические» фамилии у крестьян и мещан — обычное дело. Встречаются они и у старообрядцев, которые селились в Прибалтике, спасаясь от реформ. В любом случае, фамилия указывает на миграцию предка, на его связь с конкретным местом, которое и дало ему имя. Других известных носителей, вошедших в историю, нет — фамилия остаётся локальной и редкой.