Фамилия Канонов — один из тех случаев, когда за привычным русским окончанием -ов скрывается корень, уводящий нас не в крестьянский быт или ремесло, а в церковную и книжную среду. В основе лежит слово «канон» — церковное правило, установление или песнопение. Однако прямой путь от «канона» к фамилии неочевиден: прозвище Канон вряд ли дали бы просто так, без причины.

Самая правдоподобная версия — фамилия образована от канонического мужского имени Канон. Это имя встречается в святцах: его носил, например, святой мученик Канон Назианзин. В русской традиции такие имена, хоть и редко, давали в монашеской среде или в семьях, особо чтивших церковные тексты. От имени Канон через притяжательное прилагательное («чей? — Канонов сын») и возникла фамилия. Суффикс -ов здесь стандартный, указывающий на принадлежность к отцу.

Менее вероятно, но возможно, что фамилия произошла от прозвища Канон, которое могли дать человеку, связанному с церковным пением — певчему, знатоку канонов, или, иронично, слишком строгому блюстителю правил. В этом случае фамилия отражала бы не имя, а род занятий или характер. Однако прозвищная версия слабее: обычно такие фамилии фиксируются в формах Канонов, Канонников, где суффикс -ник прямо указывает на профессию.

Географически фамилия редкая и не привязана к одному региону. Встречается в центральных областях России, но без массового скопления. В дореволюционных источниках Каноновы могли быть как из духовного сословия (семинаристы иногда получали фамилии от церковных терминов), так и из крестьян, чей предок носил редкое имя. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» такая модель упоминается как пример образования от полных форм редких календарных имён.

Есть ещё одна деталь: в некоторых говорах «канон» означал не только церковное правило, но и «обычай, порядок». Если прозвище дали человеку, который всё делал «по канону», то есть чинно и правильно, фамилия могла приобрести бытовой оттенок. Но это уже область предположений.

Коротко: Каноновы — потомки человека по имени Канон (редкое церковное имя) или, реже, носителя прозвища, связанного с церковным уставом. Фамилия книжная, не массовая, и её носители чаще всего имели отношение к духовной среде или, наоборот, получили её как память о набожном предке.