Основой фамилии Канушкин послужило церковное имя Кандид. Фамилия Канушкин образована от имени Канушка - краткой формы таких мужских имен, как Кандид, Никандр, Никанор. В основе имени Кандид лежит латинское слово candidus, которое имеет много значений: «ослепительно белый, белоснежный», «ослепительно-красивый, блистающий красотой», «ясный, яркий, сияющий, лучезарный», «радостный, счастливый, безоблачный, безмятежный», «чистый», «искренний, чистосердечный, честный». Имя Никандр имеет византийское происхождение и образовано от слов nikao и Andros. Первая часть означает «победа» и произошла от имени греческой богини Ники. Вторая - в переводе на русский язык означает «муж, мужчина». Имя Никанор в переводе с греческого языка означает «увидевший победу». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Канушка, со временем получил фамилию Канушкин.