Фамилия Каптюхов — один из тех случаев, где на слух корень ясен, а с происхождением сразу начинаются загадки. Самая очевидная версия отсылает к слову «каптюх» — так в южных и западных говорах называли капюшон, башлык или накидку с головой. Звучит логично: прозвище Каптюх мог получить человек, который шил такие вещи, торговал ими или просто носил приметный головной убор. Однако загвоздка в том, что в большинстве русских говоров слово «капюшон» закрепилось поздно, а «каптюх» — форма скорее украинского или белорусского происхождения (ср. укр. «каптур»). Это сразу указывает на географию фамилии: её корни, скорее всего, лежат на западе или юго-западе исторической России, в зоне контакта с украинским языком.

Суффикс -ов- типичен для русской фамильной модели, он превращает прозвище в притяжательное прилагательное: «чей?» — Каптюхов, то есть сын или потомок Каптюха. В отличие от фамилий на -их/-ых, которые чаще встречаются на севере, эта модель распространена повсеместно, но её сцепка с диалектной основой «каптюх» сужает ареал. Если посмотреть на однокоренные фамилии (Каптюгов, Каптур, Каптуров), они тоже тяготеют к южнорусским и украинским землям, что подтверждает версию.

Есть и более редкая гипотеза: «каптюх» могло быть производным от «каптать» — в некоторых говорах «хватать, брать», но это уже совсем тёмная этимология, и её стоит отмести как маловероятную. Без письменных источников XVII–XVIII веков по конкретной ветви точнее сказать трудно, но ясно одно: предки носителя фамилии Каптюхов жили там, где головной убор называли не «шапкой» и не «колпаком», а именно «каптюхом».