Фамилия Капурина — женская форма, а её основа мужская — Капурин. В русской ономастике это типичная «патронимическая» фамилия, образованная с помощью суффикса -ин. Такая модель означает принадлежность: Капурин — «чей?» — «сын Капуры» или «человек из семьи Капуры». Суффикс -ин характерен для фамилий, основанных на словах, оканчивающихся на -а или -я, и в этом смысле Капурин стоит в одном ряду с Пушкиным, Репиным или Бородиным.

Сложность в том, что исходное прозвище Капура неоднозначно. Самое прямое объяснение — от слова «капур» или «капура» в значении «капюшон», «клобук», «мешок». В диалектах русского языка «капурой» называли головной убор, иногда — широкую верхнюю одежду с капюшоном. Прозвище мог получить человек, который носил такую одежду, шил её или торговал ею. В говорах Псковской и Тверской губерний «капура» — это ещё и «неуклюжий, мешковатый человек», так что прозвище могло быть ироничным, описывающим манеру одеваться или походку.

Есть и менее очевидная версия — связь с растением. В некоторых областях «капурой» называли дикую редьку или хрен (от латинского Capparis через народную этимологию). Но это объяснение спорное: прозвища от названий растений обычно образовывались через суффикс -ов (Капуров, Репнин — отдельный случай), а не -ин. Версия с капюшоном и одеждой выглядит убедительнее: она согласуется с типичными для русских фамилий прозвищами по предметам быта и одежды.

Географически фамилия Капурин встречается не повсеместно. По данным переписей и современных телефонных справочников, её ядро — северо-запад России: Псковская, Новгородская, Ленинградская области, а также Вологодчина. Это совпадает с ареалом бытования слова «капура» в значении «капюшон» или «верхняя одежда». В южных и сибирских регионах фамилия редка, что косвенно подтверждает её диалектное происхождение.

Интересная деталь: в старых писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются прозвища Капура и Капурка именно в новгородских и псковских землях. Например, в документах по Обонежской пятине упоминается крестьянин Капура, живший в конце XVI века. Отчества от таких прозвищ впоследствии и дали фамилию. Сословно Капурины, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми — дворянских родов с этой фамилией в «Бархатной книге» и гербовниках не зафиксировано.