Фамилия Карачкова — одна из тех, где сталкиваются две разные версии происхождения, и обе имеют право на существование. Первая связывает её с географическим названием — старинным городом Карачково в Псковской области. Если предок носителя фамилии был выходцем оттуда, то фамилия образовалась по типичной модели «от названия места»: человек из Карачково становился Карачковым. Сам топоним, скорее всего, произошёл от украинского диалектного слова «карачі» — «густой кустарник». То есть место, где возник город, могло быть заросшим кустарником, и это дало имя поселению.

Вторая версия выводит фамилию не от названия города, а от прозвища Карачик. Оно восходит к тюркскому слову «karaça», что означает «темноволосый» или «смуглый». Такое прозвище могли дать человеку с тёмными волосами или смуглой кожей, и со временем его потомки закрепили за собой фамилию Карачковы. Эта версия объясняет и суффикс -ов, который в русских фамилиях часто присоединялся к прозвищам, указывая на принадлежность роду Карачика.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия Карачкова — женская форма от Карачков, образованная с помощью суффикса -ов. Мужской вариант Карачков строится по той же схеме, что и многие русские фамилии от прозвищ или топонимов: основа + -ов. В данном случае основа «Карачк-» может восходить как к «Карачково», так и к «Карачик» с усечением суффикса -ик.

Какая версия правдоподобнее? Обе не противоречат друг другу. Топонимическая версия выглядит чуть более конкретной, потому что отсылает к реально существующему городу, но и тюркское происхождение прозвища вполне вероятно для русских фамилий, особенно в южных и центральных регионах, где были контакты с тюркскими народами. В любом случае, Карачковы — это либо потомки человека из Карачково, либо потомки смуглого Карачика.