Фамилия Карачковский образована от топонима Карачково — такое название носит старинный город в Псковской области. Скорее всего, основатель рода Карачковских был выходцем из этих мест. Сам топоним, вероятно, имеет тюркское происхождение и восходит к слову «karaca» - «темноволосый, смуглый». Кроме того, существует татарское мужское имя Карач. Эта же основа встречается в названиях некоторых других населенных пунктов: Карачий — в Киргизии и Старые Карачи — в Новосибирской области. По другой версии, топоним образован от украинского диалектного слова «карачi» - «густой кустарник». Оно также имеет тюркское происхождение и связано с турецким «karacali» - «терен». Возможно, на том месте, где впоследствии возник город Карачково, были заросли кустарника. Согласно еще одной, менее вероятной гипотезе, в основе топонима Карачково лежит слово «карачкуватий» - «имеющий кривые, широко расставленные ноги».