Фамилия Каракулло — редкий случай, когда прозвище напрямую связано с дорогим товаром. В её основе лежит эстонское слово karakull — «каракуль». Так называют шкурки ягнят каракульской породы, снятые на 1–3-и сутки после рождения. Мех этот ценится за густой, упругий и шелковистый волосяной покров с чёткими завитками разной формы; цвет бывает преимущественно чёрным, реже серым.

Прозвище Каракулло, скорее всего, получил человек, имевший дело с этим мехом: изготовитель шапок и воротников, скорняк, выделывающий шкурки, или купец, торговавший каракулем. В любом случае фамилия указывает на род занятий предка, а не на внешность или характер.

Сама форма Каракулло с двойным «л» и окончанием -о — нетипична для русских фамилий. Она могла сложиться в прибалтийских губерниях Российской империи, где эстонское слово karakull легко перешло в прозвище, а затем и в фамилию. Возможно, носитель был эстонцем или обрусевшим жителем региона, а фамилия закрепилась в документах уже в русифицированном виде.

Других версий происхождения у фамилии Каракулло нет: корень слишком прозрачен, чтобы искать в нём тюркские или иные смыслы. Это редкий пример, когда этимология лежит на поверхности и отсылает к конкретному ремеслу, а не к абстрактному признаку.