Фамилия Карайон — редкая, нестандартная для русского уха. В ней нет привычного суффикса -ов, -ин или -ский, что сразу наводит на мысль: перед нами не исконно русская фамилия, а скорее всего, позднее заимствование или искусственное образование. Слово «карайон» не встречается в словарях древнерусского языка, поэтому искать его корни стоит в других языках.

Самая вероятная версия — греческое происхождение. По-гречески «карайон» (καρύον) означает «орех». В этом случае фамилия могла появиться в среде греческого духовенства или торговцев, переселившихся в Россию, или же её дали в семинарии выходцу из простой семьи — по аналогии с фамилиями Орехов, Грецкий. Семинаристы часто получали фамилии, переведённые на греческий или латынь, чтобы звучало благороднее. «Карайон» могло быть таким «учёным» вариантом фамилии Орехов.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — тюркская. В тюркских языках есть корень «кара» (чёрный) и суффикс, образующий имя. Однако окончание «-йон» для тюркских фамилий нетипично. Скорее всего, если бы фамилия была тюркской, она звучала бы как Караев или Карай. Поэтому греческая гипотеза выглядит убедительнее.

Географически фамилия Карайон почти не встречается в массовых базах данных XIX века, что подтверждает её редкость. Несколько носителей зафиксированы на юге России и в центральных губерниях — как раз там, где были греческие общины и духовные училища. Сословно предки могли быть из мещан или духовенства, но не из крестьян: крестьянам такие «книжные» фамилии давали редко.

Таким образом, Карайон — это, скорее всего, искусственная семинарская фамилия, образованная от греческого слова «орех». В быту её могли дать человеку с круглой головой, крепкому или просто любителю орехов, но прямой связи с ремеслом или профессией здесь нет.