Фамилия Карначек — редкий случай, когда за основу взято не имя и не ремесло, а, скорее всего, мирское прозвище, связанное с военной службой или охраной. Если разобрать её по составу, то корень «карнач» и суффикс «-ек» указывают на западнославянское или южнославянское происхождение. Скорее всего, фамилия сформировалась на территории современной Польши, Чехии, Словакии или Украины, где суффикс «-ек» (или «-ка») типичен для уменьшительных форм и фамилий, образованных от прозвищ.

Самая правдоподобная версия связывает «карнач» с польским словом «karnacz» — в старой польской речи так называли караульного, стражника, человека, который нёс караульную службу. В некоторых диалектах слово могло означать и просто «надзиратель» или «пристав». Таким образом, первый носитель фамилии Карначек, вероятно, был либо сыном караульного, либо сам получил прозвище за службу в охране. Менее распространённая, но возможная версия — от слова «karny» (карательный, наказанный), что могло указывать на человека с суровым нравом или на того, кто имел дело с наказаниями.

Обратите внимание на суффикс «-ек». В польской и украинской ономастике он часто выполнял роль уменьшительного или патронимического (указывал на сына или младшего родственника). Например, Карначек мог означать «маленький Карнач» или «сын Карнача». Если бы фамилия была русской, она, скорее всего, получила бы окончание «-ов» (Карначев). Сохранение суффикса «-ек» — верный признак того, что фамилия не прошла русификацию и пришла в Россию с запада, возможно, вместе с переселенцами или во время службы в польских частях Российской империи.

Встречаемость фамилии сегодня невысока. Найти Карначеков можно в западных областях Украины (особенно в Тернопольской и Львовской), а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. В Польше фамилия Karnaczek тоже существует, но считается редкой. Других версий, например, от тюркского «карна» (утроба) или от названия реки Карна, лингвисты не поддерживают — они не объясняют ни суффикса, ни географии фамилии.