Фамилия Карначенко — типичный пример украинской модели образования с суффиксом -енко, который в XVI–XVIII веках закрепился в Поднепровье и Слобожанщине как указание на потомка («сын такого-то»). В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, украинские на -енко долго оставались полуфамилиями: их могли менять при переезде или передавать не по наследству, а как уличное прозвище. Карначенко — тот, чей отец или дед носил прозвище Карнач.

Корень здесь — «карнач» или «карнак». В южнорусских и украинских говорах так называли человека коренастого, приземистого, крепко сбитого. Слово родственно «корнать» — укорачивать, обрубать; карначём могли прозвать невысокого мужчину с плотной фигурой. Встречается и другая версия: от тюркского «карнак» — вид сокола или ястреба, но для украинской антропонимии эта гипотеза слабая, так как прозвища от птиц обычно образовывались иначе (Сокол, Ястреб, Беркут). Правдоподобнее связь с диалектным «карнать» — стричь, обрезать, тогда Карнач — человек с короткой стрижкой или тот, кто занимался стрижкой овец.

Географически фамилия тяготеет к Черниговщине, Полтавщине и Харьковщине — регионам, где суффикс -енко был основным способом фиксации родства. В метрических книгах XIX века Карначенко встречаются преимущественно среди казаков и государственных крестьян, реже — среди мещан. Дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано: она осталась в низовых сословиях, что типично для поздних украинских фамилий, не успевших попасть в гербовники.

Интересная деталь: в некоторых переписях фамилию записывали через «о» — Корначенко, что прямо указывает на диалектное произношение (аканье для украинского языка нехарактерно, но в пограничных с Россией уездах встречалось). Такие варианты — Корначенко, Карначук — помогают проследить миграцию носителей: если человек из Воронежской губернии носил фамилию Корначенко, его предки почти наверняка пришли с Левобережной Украины.