Фамилия Карпуничевы происходит от просторечной формы крестильного имени Карп. Имя древнегреческое, в переводе — «плод». В церковной традиции почитаются великомученик Карп Пергамский и апостол от семидесяти Карп, сподвижник апостола Павла. В народе имя Карп давало множество производных форм: Карпуня, Карпуха, Карпуша. Фамилия образована от одной из них — Карпуня — по стандартной русской модели с суффиксом -ев, который присоединялся к основам на мягкий согласный. Получается, что Карпуничев — это «сын Карпуни».

Важно: фамилия не имеет отношения к рыбе карп, несмотря на внешнее сходство. Связь с рыбой — позднее народное переосмысление, которое ономасты не поддерживают.

С точки зрения словообразования фамилия примечательна редким вариантом суффикса. В русских фамилиях от имени Карп чаще встречаются Карпов (от полной формы) и Карпушин (от Карпуша). Форма с суффиксом -ичев встречается реже — она указывает на отчество от имени Карпуня через промежуточную форму Карпунич. Это говорит о том, что фамилия закрепилась в тех говорах, где была распространена именно уменьшительная форма Карпуня, а не Карпуша.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодской, Костромской, Нижегородской губерниям, где имя Карп и его производные были особенно популярны в крестьянской среде. Точную дату возникновения назвать нельзя: процесс становления фамилий растянулся на несколько веков, с XV по XVIII. Но по модели образования (отчество на -ичев) фамилия скорее поздняя, не ранее XVI века.

Таким образом, Карпуничевы — потомки человека по имени Карпуня, которое когда-то звучало как ласковое домашнее прозвище и лишь потом стало официальным родовым именем.