Фамилия Карпышенко звучит как типичная украинская фамилия, и её разбор подтверждает это. Суффикс -енко — один из самых распространённых в украинской ономастике, он означает «сын» или «потомок». То есть Карпышенко — это буквально «сын Карпыша». Основа здесь — прозвище Карпыш, которое, в свою очередь, образовано от крестильного имени Карп.

Имя Карп пришло из греческого языка и означает «плод». В народной среде оно было популярно, и от него возникло множество уменьшительных и пренебрежительных форм: Карпуша, Карпун, Карпыш. Последняя форма, с суффиксом -ыш, могла обозначать либо молодого человека (парня, подростка), либо, наоборот, человека невысокого роста или щуплого телосложения — в зависимости от интонации и контекста прозвища.

Интересно, что фамилия Карпышенко не так частотна, как её «старшие» родственники — Карпенко или Карпов. Это говорит о том, что её носители, скорее всего, происходят из конкретного, не самого крупного рода. Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Слобожанщине, где суффикс -енко закрепился как основной фамильный формант. В России, особенно на Кубани и в южных регионах, она тоже встречается, но как принесённая переселенцами.

По социальному происхождению носители фамилии почти наверняка были крестьянами или казаками. В среде украинского казачества и крестьянства фамилии на -енко складывались стихийно в XVI–XVII веках, и Карпышенко — яркий образец такой «патронимической» фамилии, где прозвище отца (Карпыш) закрепилось за всем его потомством. Никакой альтернативной версии от названия рыбы «карп» здесь нет — основа именно личное имя, а не нарицательное.