Фамилия Карсеев образована от прозвища или имени Карсей. Основа здесь — «Карс-», а суффикс «-ев» указывает на принадлежность: «сын Карсея». Такая модель типична для русских фамилий, возникших из отчеств. Но вот что именно скрывается за основой — вопрос более интересный.

Самая вероятная версия: корень восходит к тюркскому слову «карс» — «противник, враг». В этом случае прозвище Карсей могли дать воинственному, строптивому человеку, тому, кто постоянно спорил или перечил. В русских говорах слово «карс» встречалось реже, но могло означать «морщина, складка» — тогда прозвище относилось к внешности: человека с морщинистым лицом или хмурым выражением. Обе версии имеют право на жизнь, но первая, тюркская, выглядит убедительнее: в южнорусских и поволжских регионах, где русские долго соседствовали с тюркскими народами, такие прозвища были обычным делом.

Менее распространённая гипотеза связывает Карсеева с греческим именем Карп (через форму Карсей). Однако для этого пришлось бы допустить редкое фонетическое изменение, которое не подтверждается массовыми данными. Поэтому эту версию стоит считать маловероятной.

Фамилия Карсеев — довольно редкая. По переписям XIX–XX веков она встречалась преимущественно в Курской, Воронежской и Саратовской губерниях, что косвенно подтверждает её южнорусские корни и возможную связь с тюркскими заимствованиями. В отличие от фамилий на «-ов» от крестильных имён (Иванов, Петров), Карсеев стоит в ряду прозвищных фамилий, которые рассказывают не о святом покровителе, а о характере или внешности конкретного предка.