Фамилия Кацубска — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает любую другую версию происхождения. В отличие от массовых фамилий на -ов или -ин, форма Кацубска — это типичная «переселенческая» фамилия, которую в России или Беларуси могли получить выходцы из конкретного места.

Скорее всего, основа здесь — топоним Кацубск или Кацубы. Такое название могло существовать в Польше, Западной Беларуси или на Украине, где распространены названия с корнем «кац-» (от польского kaczy — утиный, или от старого личного имени Кац — сокращение от Кацпер, то есть Каспер). Фамилии на -ский в этой традиции давали дворянам по названию имения, но в XIX веке их часто получали и крестьяне, и мещане, переселившиеся в другой регион и записанные по месту прежнего жительства. То есть предок носителя фамилии был «тот, кто из Кацубска» — шляхтич, владевший хутором, или просто выходец из деревни Кацубы.

Суффикс -ск- указывает на притяжательное или географическое значение, а окончание -а — на женскую форму. В русском языке фамилия могла закрепиться именно в женском варианте (Кацубска) у носительницы, которая не меняла её по мужскому роду, или же изначально была записана как Кацубский/Кацубская. В польской традиции форма Кацубска (Kacubska) — это стандартная женская фамилия от мужской Кацубский (Kacubski). Если носитель — мужчина, то его полная фамилия должна быть Кацубский, а Кацубска — это либо ошибка в документах, либо адаптация под русскую грамматику (где женские фамилии на -а склоняются, а мужские на -ский — нет, что неудобно).

Спорных версий здесь немного. Корень «кац-» иногда связывают с еврейским именем Кац (аббревиатура «коэн цедек»), но в таком случае фамилия была бы Кац или Кацман, а не Кацубска. Вариант с «утиным» происхождением (от польского kaczka — утка) маловероятен, так как для этого использовали бы суффикс -ин: Кацкин. Поэтому самая рабочая гипотеза — топонимическая, с польским или западнорусским следом. Фамилия редкая, в крупных базах данных встречается единично, что подтверждает её локальное происхождение: предки, скорее всего, не были многочисленным родом, а происходили из одного небольшого поселения.